El Laboratorio de Metagenómica y Metatranscriptómica forma parte del Centro Regional de Estudios Genómicos (CREG), Facultad de Ciencias Exactas de la Universidad Nacional de La Plata (UNLP), y se integra como parte integrante al CENEXA (Centro de Endocrinología Experimental y Aplicada, CONICET-UNLP).
La Dra. Christina B. McCarthy dirige las líneas de investigación que se desarrollan en el laboratorio.
En este laboratorio se analiza el microbioma de diversos y diferentes ambientes para descubrir cómo utilizarlo para beneficio humano. El microbioma se puede definir como la colección de microorganismos y condiciones de un ambiente particular, y hay un número creciente de estudios que lo vinculan con la salud humana y la sustentabilidad ambiental, entre otros. La metagenómica permite caracterizar e inferir la función potencial del microbioma, mientras que la metatranscriptómica permite obtener una imagen de su perfil funcional (y taxonómico) activo. Actualmente se analiza el metatranscriptoma asociado a diferentes insectos (vectores de enfermedades infecciosas e insectos plaga), y el metagenoma asociado a suelos prístinos. Los campos de aplicación incluyen la búsqueda de potenciales agentes de control biológico y la biorremediación de suelos contaminados, entre otros.
Líneas de Investigación
A continuación, se presentan las principales líneas de trabajo que se desarrollan actualmente en el laboratorio:
La microbiota tiene roles importantes y muchas veces esenciales durante el crecimiento y desarrollo de muchas especies de insectos. Por otro lado, los microorganismos asociados a vectores de diferentes enfermedades podrían ejercer un efecto patogénico directo sobre el hospedador, interfiriendo con su reproducción o reduciendo su competencia vectorial. Sin embargo, a pesar de su importancia, todavía es escasa la información disponible para muchas especies de insectos. En este contexto, trabajamos con dos insectos: Lutzomyia longipalpis, insecto flebótomo vector de leishmaniasis visceral, y Spodoptera frugiperda, lepidóptero plaga del maíz.
La biorremediación involucra el uso de microorganismos autóctonos o introducidos (alóctonos) para degradar, transformar y/o esencialmente eliminar contaminantes del suelo y agua. Los extremófilos son microorganismos adaptados a vivir en condiciones extremas físicas y/o geoquímicas, que han desarrollado extremozimas con un gran potencial biotecnológico. El enfoque metagenómico genera un valioso banco de datos donde encontrar nuevos genes que codifican productos génicos biotecnológicamente útiles. En las últimas décadas la agricultura argentina, de producción intensiva, está dejando innegables secuelas de erosión y susceptibilidad a la socavación, además del empobrecimiento de la biodiversidad y de los ecosistemas. En función de generar herramientas con potencial para la biorremediación de suelos, se está caracterizando la composición de microorganismos capaces de proliferar en ambientes extremos y sus extremozimas asociadas.Financiamiento
Publicaciones
Estas son las publicaciones más destacadas realizadas en los últimos años: